国家控股公司内部可分为以下三个层次：
第一层是跨行业、跨部门的巨型综合性国有控股公司。这类控股公司属于大型财团性质，是从事资本经营活动的投资公司。公司的任务是：负责经营管理国家拥有的股份；指导、协调各子公司的投资、经营和生产活动；向子公司提供必要的财政支持和信息、技术、人才服务；选拔子公司的高级领导等。
第二层是若干次级专业控股公司。这类公司按行业或部门组成，专业性较强，可发行股票，是金融性与生产经营性结合型的公司。它所控制的三级公司，少则几个，多则几十个不等。
第三层是基层参与制企业。它们直接从事生产经营活动，可以发行股票。
国家控股公司是自主经营管理的机构，接受内阁委员会和国家参与部的管理和指导。实行国家参与制的优点，一是所有权与经营权分离；二是便于国家对企业进行间接调控；三是组织形式严密，有利于真正实现政企分开。
国有控股企业和国企的区别：
1、定义区别：
国有控股企业是指在企业的全部资本中，国家资本股本占较高比例，并且由国家实际控制的企业。
国有企业是指企业全部资产归国家所有，并按《中华人民共和国企业法人登记管理条例》规定登记注册的非公司制的经济组织。
2、控股区别：
国有控股企业分为国有绝对控股企业和国有相对控股企业。国有绝对控股企业是指国家资本比例大于50%（含50%）的企业。国有相对控股企业是指国家资本比例不足50%,但相对高于企业中的其他经济成分所占比例的企业（相对控股），或者虽不大于其他经济成份，但根据协议规定，由国家拥有实际控制权的企业（协议控制）。
国有企业是国家对其资本拥有所有权或者控制权，政府的意志和利益决定了国有企业的行为。
3、关系不同：
国有企业包括国有控股公司。