1、交易场所不同
深港通主要涉及深圳证券交易所和香港联合交易所；沪港通则涉及上海证券交易所和香港联合交易所。
2、标的不同
沪港通的标的股票范围较小，仅包括266只成分股。深港通的标的股票包括市值在50亿元港币及以上的恒生综合小型股指数成份股，以及深圳市场的成分股，标的范围更广。
3、开通时间不同
沪港通开通时间是2014年11月17日；深港通开通时间是2016年12月5日。
沪港通是指上海证券交易所和香港联合交易所允许两地投资者通过当地证券公司（或经纪商）买卖规定范围内的对方交易所上市的股票，是沪港股票市场交易互联互通机制。
深港通指的是深圳证券交易所和香港联合交易所有限公司建立技术连接，使内地和香港投资者可以通过当地证券公司或经纪商买卖规定范围内的对方交易所上市的股票，属于深港股票市场交易互联互通机制。
总的来说，沪港通是指内地投资者可以通过上海证券交易所买卖香港交易所上市的股票。内地投资者需要通过在内地的券商开立沪港通账户，并符合一定的资格要求才能进行交易。深港通是指内地投资者可以通过深圳证券交易所买卖香港交易所上市的股票。与沪港通类似，内地投资者需要在内地的券商开立深港通账户，并符合一定的资格要求。