港股通证券组合费是按照投资者持有港股通股票的市值以及特定的年费率来收取的。
具体计算方式如下：证券组合费=所持有港股通股票的市值*年费率/365天。通常情况下，年费率是0.008%，但是当投资者持有的港股通股票市值超过一定数额（例如港币500亿元），年费率可能会降低，具体降低的比例根据不同的市值区间而定。例如，市值大于港币500亿元，小于或等于2,500亿元时，年费率可能为0.007%；市值大于港币2,500亿元，小于或等于5,000亿元时，年费率可能为0.006%，依此类推。
证券组合费是按每个自然日收取的，即每日都会根据投资者收盘时的持股市值计算并扣除相应的费用。即便计算出来的费用非常小，也存在一个最低收费的标准，通常是0.01元人民币。
值得注意的是，在开户时，您的账户可能会被冻结一部分资金作为证券组合费的预存款，这笔资金会用于抵扣日常产生的证券组合费。
港股通证券组合费是针对通过港股通机制参与港股交易的投资者所收取的一项费用，主要是为了覆盖香港结算公司提供的存管和公司行为服务成本。
请注意，除了证券组合费外，港股通交易还涉及到其他费用，如佣金、交易印花税、交易系统使用费、股份交收费等，所有这些费用加起来构成了港股通交易的总成本。